Историческое освоение острова Южно-Сахалинск авиацией началось в 1930 году. Легендарный летчик М. Водопьянов и бортмеханик Н. Аникин совершили первый рейс по маршруту Хабаровск - Тамбовское - Мариинск - Николаевск - Оха - Александровск...

В 1947 году поменялось руководство аэропорта, на смену К. Полозову пришел Лавров Иван Семенович, который руководил предприятием до июля 1950 года. В сентябре того же года было решено объединить аэропорт Южно-Сахалинска и 198-й лётный отряд...

До 1950-х годов гражданская авиация не имела своих аэродромов, все самолеты были вынуждены приземляться на военных аэродромах. Только в конце 50-х годов гражданскому воздушному флоту стали передаваться устаревшие к тому времени аэродромы военного ведомства...

В 1955 году было решено объединить лётный парк Александровска-Сахалинского и Южно-Сахалинска, на их основе сформировался 147-й объединенный авиаотряд Дальневосточного управления ГВФ с базой в Южно-Сахалинске...

В 1963 году 147-й авиаотряд преобразуется в Южно-Сахалинский ОАО. Был введен в строй новый Хомутовский аэродром, который стал основной базой Южно-Сахалинского ОАО...

Новый аэропорт получил возможность принимать современные самолеты АН-10 и ИЛ-18, что значительно сократило время полета на материк...

В конце 1989 года Южно-Сахалинскому аэропорту было решено присвоить статус международного. Министерство гражданской Авиации СССР приняло решение открыть аэропорт для международных полетов...

С 2002 года продолжается перестройка ФГУП "Аэропорт Южно-Сахалинска". В международном секторе установили современные пункты пропуска пограничного контроля пассажиров, был расширен багажный зал, были установлены четыре новые стойки для регистрации пассажиров и появились два входа на зону досмотра, что позволяло обслуживать одновременно два рейса и увеличить пропускную способность аэровокзала...

Главные задачи, которые стоят перед аэропортом сегодня, это привлечение к сотрудничеству наибольшего числа авиакомпаний, качественное и надежное выполнение технологических процессов и обеспечение наибольшего комфорта и безопасности пассажиров...

В "Южно-Сахалинском" аэропорту объем перевозок пассажиров за последние три года увеличился с 473 тысяч до 581 тысячи человек. Основное увеличение пассажиропотока произошло за счет международных направлений...

В дальнейшем планируется увеличение ежедневных вылетов рейсов на популярные направления, изменение типов воздушных судов, а для удобства транзитных пассажиров изменение времени вылета, пассажирам, которые летят на отдых, введение новых международных рейсов...

В 2002 году по итогам конкурса "Лучший аэропорт года стран СНГ" ФГУП "Аэропорт Южно-Сахалинск", среди аэропортов с объемами перевозок от 100 тысяч до 500 тысяч человек, завоевал первое место с вручением Кубка и Почетной грамоты Ассоциации "Аэропорт"...